在19世纪末俄国远东需要大量的工人，很多中国人来俄国做矿工和建筑工人。他们一般是山东和直隶的穷苦人，从烟台上船到海参崴登陆。在1900年爆发庚子俄难，海参崴、海兰泡和江东64屯的中国人遭到屠杀和驱逐。
俄国借口东北义和团拆毁铁路而发动了对中国人的驱逐和屠杀，海兰泡和江东64屯中国人被杀7000余人，整个远东地区中国人被杀2万余人，很多日本人因为长得像中国人也一并被杀。美国记者形容要比西班牙中世纪杀死异教徒更惨烈。
清政府在江东64屯派出了300军队渡过黑龙江和俄军激战打伤俄军中尉连长，动员了30艘兵船20艘商船把大部分华人营救过江，但江东64屯的管辖权就此丢失。
庚子俄难是俄军赶走本土中国人的行动，但是来打工的中国工人仍然大量需要。到1917年十月革命前夕，远东的中国工人已经将近16万人，整个远东地区的中国人有24万余人。在后面的20余年里，他们悲惨的命运来临了。
1917年后的俄国内战远东的中国人的厄运来临，不论红军白军都抢劫杀害中国人。白军抢劫中国商人并将尸体挂在树上，红军抢劫中国人聚集地强奸妇女，只要不会说俄语的中国人一律当间谍处死。
内战结束后，列宁启动新经济运动鼓励生产，开始注重吸引中国人来远东地区工作经商。因内战逃离的中国人又回来并很快掌握了当地的经济命脉。在1920年代初期，中国人掌握了远东地区一半以上的商业和贸易份额，48.5%的日用杂货，22.1%的食品烟草酒类，10.2%的餐厅酒店都掌握在中国人手里。
在海参崴的百万街一带，是中国人的聚集区。数万中国人在此居住，有自己的管理机构，除了向苏方纳税之外，一切都是中国人自治。但苏中两国人一直处于敌对状态，苏联人认为中国人是和犹太人一样的奸商，出卖假冒伪劣产品；中国人认为苏联人是暴力的酒鬼，懒惰而不守信用。
在1926年苏联就开启了强制迁移当地朝鲜人的行动，朝鲜人被强行迁移到乌兹别克斯坦。苏联方面同样担心中国人人数众多财力雄厚不受控制，并怀疑中国人聚集区窝藏日本间谍。但中国母国实力比朝鲜强大，同时即使迁移到中亚地区仍然离母国太近，所以一开始并未对中国人有强制措施。
此时苏联制定了严格的法规限制中国人将财富带回中国，每次回国需要缴纳14卢布的出境费，寄回国的包裹收34%的重税，出境中国人必须接受裸体检查，严格控制向中国人发放苏联签证。
1929年中东铁路事件爆发后，苏联中断了和中国的关系，开始迫害中国人。很多中国人被驱逐出境，离境时只许带30卢布的现金。发现身上有大量现金的中国人立即以资产阶级的罪名逮捕。有7000多富有的中国人被逮捕，他们被施以酷刑没收财产，发配去修伯力（哈巴罗夫斯克）的铁路。每天只给两片黑面包，很多人累饿而死。
1930年6月在百万街附近发生了一次中苏冲突械斗，有27人因此致残，加强了苏联当局清理中国人的决心。在和中国政府签订了《哈巴罗夫斯克协议》后，两国恢复邦交，被抓走并幸存的中国人被释放，但是所有财产已经被没收，只有回国。同时苏联方面禁止中国人入境，开始清理剩下的中国人。
1932年伪满洲国成立，苏联不允许中国人进入国境，同时强行驱逐中国人，这些人只能带少量财物离开，留下的房屋资产均被没收。苏联同时开始向远东移民，按每年3万人的计划从欧洲部分迁移俄国人来巩固统治。
1934年苏联领导人列宁格勒州委书记基洛夫被暗杀，斯大林下令举国严查，开始了大清洗运动。运动涵盖远东地区，先是将逃亡到远东的25000白俄逮捕关进集中营，这些白俄有些已经取得中国国籍有些是中俄混血，但是苏联方面坚持只要是和本人俄罗斯帝国政府有关系或亲属有关系则一律清洗。接着又开始了远东地区外国人的清洗，中国人排名第一。
1937年对远东中国人、朝鲜人、德国人和波兰人的清理正式开启，秘密警察的总头目尼古拉·叶若夫向远东秘密警察头目柳什科夫传达了《制止中国叛徒和间谍的计划》文件，要求彻底清除中国人的潜在威胁，成立3人审判小组，凡是被三人小组定罪者可立即枪决不经法庭审判。
秘密警察头目尼古拉·叶若夫，是斯大林的忠实走狗，曾经权倾朝野。在他主持的大清洗中150万人被捕，其中一半被枪决。但当二战打响需要收买人心时，他被推出来当替罪羊。1940年被打成叛徒、德国间谍、妄图谋害斯大林的凶手，酷刑招供后在地下室被处决。苏联解体后他的养女曾上书要求给他平反，但被俄国最高法院驳回。
1937年12月24日平安夜，所有波兰人德国人均被逮捕关到西伯利亚的集中营。同时用了3天时间清理了海参崴的朝鲜人街区，所有人被押上火车运到乌兹别克，反抗者就地枪决。当天晚上中国人聚集的百万街也受到清理，中国人开始反抗并发生枪战。7名苏联士兵被打死434名中国人被杀，其余人均被抓进集中营。在2010年6月8日，175具死难中国人的遗体在百万街被发现，其中包括两个孩子。
在大清洗时有几千中国人寻求了中国领事馆的庇护被保护起来，苏联当局在大清洗之后不再搜捕中国人，这些人就离开了领事馆。一个月后，苏联人封锁了中国领事馆周边后又一次大肆搜捕中国人，这次有8000中国人被捕很多人在狱中被折磨致死。至此海参崴没有被抓的中国人只剩下1000余人。仅在赤塔地区就抓了1500名中国人，其中568名在狱中被酷刑折磨致死。
1938年4月在中国外长著名法学家王宠惠的斡旋下和苏联达成7点协议：
- 苏联负责中国人迁移的费用，为绕开伪满洲国取道新疆。
- 苏联给中国人提供2周到一个月的时间处理财产。
- 愿意留在苏联且有劳动能力的中国人会被迁往中亚。
- 苏联政府协助离开的中国人出售留下的房产。
- 拟定愿意留在苏联的中国人名单并向中国方面提供备案。
- 中国人的苏联配偶可以跟随返回中国。
- 除非犯有重罪，立即释放在押的所有中国人。
1936年6月，苏联颁布了《迁移远东中国人》的文件，规定了对远东中国人的4种处理办法：1）运送到新疆归国；2）想留下的迁移到哈萨克斯坦；3）指控轻的就地释放；4）指控重的关进古拉格劳改营。
1938年6至7月，一共有11412名中国人通过新疆返回国内。迁移到哈萨克的中国人5763人，释放的中国人3794人，其中941人被押解到伯力（哈巴罗夫斯克）再释放。迁移的中国人里的196名知识分子主要是工程师被迁移到高加索地区，其中34人被迁移到亚美尼亚的埃里温。逮捕和处决的中国人一共9380人，其中处决的3922人。
被迁移的人到了目的地就恢复自由，被枪决的人是立即处死掩埋。而最悲惨的是关进古拉格劳改营的人，他们几乎最后都被折磨致死，只有一少半的人可以活下来。劳改营也分好地段和坏地段，温暖一点地方的劳改营，从事民用建筑和畜牧的存活率高。像哈萨克的劳改营关押中国人存活率就达到97%。
而西伯利亚从事军工的劳改营则关押的中国人经常冻饿累而死，比如搬运原木的劳改营经常需要工作12到14小时，中国人被分配十人一组，往往两周就会累死。例如以非法越境名义抓捕的300名中国人，在3个月后除了一名当厨师的中国人幸存之外，其余全部死亡。
截至1942年1月，在古拉格劳改营关押的中国人有5192人，其中2632人死亡，734人失踪。在1945年有214名古拉格关押的中国人被编入苏军参加对日作战，对他们是难得的好运气了。
二战结束后关在劳改营的中国人仍然没有被释放，直至1953年斯大林去世后赫鲁晓夫上台开始清理斯大林时代的恶政，幸存的1826人后来被陆续释放。在1956年6月17日最后38名中国囚犯被释放，远东大清洗正式结束。
远东中国人遇到的迫害一共有4次，1900年庚子俄难，1917年俄国内战，1929年中东铁路事件和1936年的大清洗。前三次都是找了借口开始迫害，但并未动摇中国人的根基。最精细最彻底的是1936年的大清洗，留下的资料也最详细。到1941年，曾经有20多万中国人的远东已经几乎见不到一个中国人了。
在莫斯科红十字协会大楼里为一位叫王希祥的山东人挂了一块小小的纪念牌，1888年出生的王希祥是一名洗衣店的熨烫工，无党派文盲。但是在1936年3月18日他被指控间谍罪逮捕，9月10日48岁的山东农民被枪决。90年代苏联给他恢复了名誉定为冤案，2017年俄国人在他住过的地方挂了纪念牌来纪念他。
时至今日，在远东地区还经常可以发现一些遗骨，他们身边的一些遗物显示他们是中国人。他们再也没有机会回到故乡。他们也没有王希祥的好运气，他们是谁家乡是哪里也无人得知。
